Arnara fu un feudo dei conti de Ceccano, ma nel 1121 il Papa Callisto II attaccò la città, per punire i conti per il favoritismo che facevano all’imperatore.
La chiesa Madonna del Carmine di Arnara venne costruita alla fine del 1700 durante i lavori di sistemazione idraulica delle acque dell'attigua fonte.
La Chiesa di San Sebastiano si distingue per il suo stile barocco con interno a croce greca.